48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1512 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1512  protein of unknown function DUF606  100 
 
 
365 aa  689    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.777644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6497  protein of unknown function DUF606  44.48 
 
 
330 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  43.03 
 
 
316 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  37.54 
 
 
333 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  35.71 
 
 
315 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0874  hypothetical protein  42.54 
 
 
314 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  39.61 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  31.74 
 
 
323 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  31.74 
 
 
323 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  31.74 
 
 
323 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  31.74 
 
 
322 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  31.74 
 
 
323 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  31.29 
 
 
321 aa  106  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  32.57 
 
 
333 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  29.62 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  28.34 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  26.33 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  30.63 
 
 
174 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  32.26 
 
 
178 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  35.8 
 
 
151 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  26.41 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  37.37 
 
 
146 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  37.32 
 
 
149 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  27.43 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  27.43 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  23.65 
 
 
297 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  27.87 
 
 
147 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5701  hypothetical protein  29.6 
 
 
145 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  30.77 
 
 
147 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  29.34 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  31.01 
 
 
146 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  36.84 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  35.62 
 
 
176 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  36.84 
 
 
172 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  31.33 
 
 
146 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  38.89 
 
 
163 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  29.69 
 
 
145 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  29.27 
 
 
144 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  35.56 
 
 
148 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  32.18 
 
 
151 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  31.75 
 
 
145 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  30.53 
 
 
172 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  34.07 
 
 
147 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  26.98 
 
 
151 aa  42.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  20 
 
 
386 aa  43.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  32.18 
 
 
151 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  31.58 
 
 
176 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>