160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2825 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  76.87 
 
 		 172 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  72.67 
 
 		 176 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  76.35 
 
 		 172 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  55.56 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  67.97 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  54.19 
 
 		 184 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  51.8 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  51.8 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  47.1 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  49.29 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  48.26 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  47.55 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  42.96 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  42.11 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  42.25 
 
 		 146 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  40.54 
 
 		 146 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  37.84 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  43.36 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  41.41 
 
 		 148 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  44.26 
 
 		 170 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  35.92 
 
 		 147 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  46.02 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  41.18 
 
 		 147 aa  91.3  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  42.75 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  42.76 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  33.1 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  40.15 
 
 		 132 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  34.29 
 
 		 148 aa  84.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  36.62 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  39.01 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  37.93 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  40.48 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  37.5 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  38.24 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  36.43 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  77.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  35.07 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  37.98 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  36.23 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  37.41 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  36.5 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  36.96 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  36.69 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  36.96 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  32.86 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  31.94 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  32.14 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  38.03 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  30.71 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  38.03 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  36.62 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  34.9 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  33.1 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  33.1 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  33.1 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  34.78 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  31.43 
 
 		 307 aa  67.8  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  38.62 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  37.36 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  35.88 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  41.98 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  36.26 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  36.26 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  36.3 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  32.64 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  33.06 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  29.8 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  31.88 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  32.62 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  30.14 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  28.26 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  30.14 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  28.76 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  28.78 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  30.14 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  34.65 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  34.72 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  29.5 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  34.18 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  28.38 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  32.03 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  29.29 
 
 		 297 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  29.2 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  27.89 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  29.2 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  30.56 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2963  hypothetical protein  25.17 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.41688  normal  0.045431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  27.81 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  32.39 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  28.47 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2369  hypothetical protein  25.17 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  31.29 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  32.99 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  27.34 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>