153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5246 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  349  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  58.04 
 
 		 174 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  53.02 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  54.19 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  54.68 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  54.68 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  61.38 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  59.71 
 
 		 172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  47.33 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  48.28 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  57.35 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  46.91 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  51.11 
 
 		 151 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  48.57 
 
 		 151 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  43.88 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  42.54 
 
 		 148 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  41.73 
 
 		 147 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  44.72 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  35.92 
 
 		 147 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  44.27 
 
 		 132 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  40.14 
 
 		 148 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  37.5 
 
 		 147 aa  92.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  41.94 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  42.15 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  35.62 
 
 		 146 aa  91.3  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  39.44 
 
 		 148 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  37.23 
 
 		 146 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  39.72 
 
 		 146 aa  87.8  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  36 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  41.41 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  40.44 
 
 		 149 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  37.59 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  32.59 
 
 		 147 aa  85.1  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  43.75 
 
 		 148 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  36.88 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  43.8 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  37.12 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  36.43 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  38.03 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  36.43 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  30.11 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  38.1 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  36.69 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  37.06 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  30.5 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  32.87 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  34.59 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  31.13 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  39.71 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  33.83 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  34.88 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  38.24 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  32 
 
 		 147 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  26.09 
 
 		 148 aa  72  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  36.09 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  30.37 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  34.35 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  34.72 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  33.82 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  31.2 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  30.14 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  32.35 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  30.97 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  29.31 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  39.71 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  34.09 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  34.07 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  32.61 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  32.37 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  31.88 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  31.88 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  29.37 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.08 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  27.14 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  32.35 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  28.67 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  28.67 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  36.89 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  28.78 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  32.84 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  35.88 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  33.58 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  32.17 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  35.38 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  35.2 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  33.83 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  31.85 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  34.07 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  32.58 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  33.08 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  34.71 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  31.11 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  33.59 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  33.59 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  33.59 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  27.46 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>