49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6653 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  100 
 
 		 144 aa  276  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5701  hypothetical protein  87.41 
 
 		 145 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2131  protein of unknown function DUF606  42.36 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  38.51 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  37.68 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2290  hypothetical protein  38.24 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  30.6 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  29.37 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  29.66 
 
 		 333 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  40 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  28.33 
 
 		 335 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  33.93 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  33.03 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  30.12 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  30.28 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3456  hypothetical protein  24.67 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  28.07 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1792  hypothetical protein  24.67 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3164  hypothetical protein  26.06 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  27.19 
 
 		 386 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3167  hypothetical protein  27.34 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3464  hypothetical protein  24.67 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.060266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3472  hypothetical protein  24.67 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0520  protein of unknown function DUF606  31.58 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000146462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  31.33 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3230  hypothetical protein  24.67 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000207849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  30.84 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3799  hypothetical protein  32.74 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000162069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3483  hypothetical protein  27.34 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  30.34 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  29.71 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  37.7 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  30.12 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  32.94 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3512  hypothetical protein  27.68 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3257  hypothetical protein  27.68 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  30.12 
 
 		 176 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  31.76 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  32.56 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  29.71 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  25.36 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  27.45 
 
 		 317 aa  40  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>