52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2602 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  40 
 
 
333 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  42.03 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  37.82 
 
 
315 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6497  protein of unknown function DUF606  42.7 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  37.94 
 
 
316 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0874  hypothetical protein  39.22 
 
 
314 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  30.07 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  29.89 
 
 
323 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  29.89 
 
 
322 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  29.89 
 
 
323 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  29.89 
 
 
323 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  29.89 
 
 
323 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  31.46 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1512  protein of unknown function DUF606  32.58 
 
 
365 aa  86.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.777644  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  25.61 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  28.06 
 
 
317 aa  63.2  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  34.59 
 
 
184 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  37.68 
 
 
146 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  20.39 
 
 
386 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  32.06 
 
 
146 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  23.16 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  29.82 
 
 
151 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  37.07 
 
 
149 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  27.4 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  29.41 
 
 
172 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  36.72 
 
 
146 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  29.8 
 
 
162 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  39.73 
 
 
148 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  34.81 
 
 
142 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  34.62 
 
 
152 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  36.47 
 
 
146 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  28.08 
 
 
178 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  35.66 
 
 
144 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  34.72 
 
 
148 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  34.03 
 
 
149 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  23.49 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  32.35 
 
 
146 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  30.61 
 
 
174 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  29.92 
 
 
144 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  36.72 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  34.71 
 
 
156 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  34.71 
 
 
156 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  27.89 
 
 
153 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  32.74 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  29.03 
 
 
148 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  37.19 
 
 
132 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  33.71 
 
 
153 aa  43.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  27.21 
 
 
153 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  28.95 
 
 
151 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  34.29 
 
 
148 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>