127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2345 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  285  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  52.82 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  51.8 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  44.67 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  37.96 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  35.71 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  48.65 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  34.07 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  47.3 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  30.37 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.8 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  31.16 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  30.95 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  28.78 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  30.28 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  31.47 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  34.56 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  30.94 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  34.18 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  40.51 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  35 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  28.03 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  32.26 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  26.47 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  31.34 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  34.17 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  30.56 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  34.09 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  34.17 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  30.41 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  31.43 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  36.71 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  33.83 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  29.29 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  32.56 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  29.71 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  32.35 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  29.71 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  31.47 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  31.67 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  32.91 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  34.18 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  31.25 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  31.65 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  30.5 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  29.71 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  30.66 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  32.52 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  29.79 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  33.61 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  30.43 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  31.85 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  30.99 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  31.82 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  34.21 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  26.09 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  27.5 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  30.37 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  33.91 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  27.27 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  32.35 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  31.17 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  28.15 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  28.74 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  31.17 
 
 		 333 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  34.57 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  30.08 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  30.94 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  34.57 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  29.23 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  37.29 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  28.1 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  28.26 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  42.47 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  32.91 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  28.26 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  30.41 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  41.1 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  32.03 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  30.3 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  28.79 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  32.35 
 
 		 315 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  30.53 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  26.32 
 
 		 309 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  26.32 
 
 		 309 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  29.03 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  29.27 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  30.47 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  32.37 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  30.47 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  29.2 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  30.83 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>