63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2771 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  284  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.86 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  35.71 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  25.71 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  27.14 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  31.91 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  28.78 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  28.47 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  27.66 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  34.57 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  28.99 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  32.5 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  29.32 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  27.34 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  24.64 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  23.4 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  28.47 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  29.6 
 
 		 317 aa  54.7  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  27.54 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  33.07 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  29.71 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  28.78 
 
 		 318 aa  49.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  30.71 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  33.78 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  26.09 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  25.71 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  26.47 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  30.17 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  34.25 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  27.21 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  31.17 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  25.18 
 
 		 151 aa  48.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  25.18 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  22.46 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  28.99 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  34.18 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  30.5 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  25.55 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  35.06 
 
 		 309 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  35.06 
 
 		 309 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  24.29 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  34.62 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  27.74 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  26.39 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  25 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  25.18 
 
 		 297 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  22.63 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  27.06 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  25.84 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  25 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  25.35 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  31.65 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  22.86 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  27.86 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  28.95 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  25.56 
 
 		 305 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>