142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4040 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  100 
 
 		 148 aa  293  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  51.35 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  40.82 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  33.11 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  36.23 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  38.57 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  35.17 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  37.86 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  38.21 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  33.81 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  29.93 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  32.86 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  34.07 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  34.29 
 
 		 172 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  35.53 
 
 		 151 aa  84.3  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  35.42 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  30.99 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  37.5 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  34.69 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  34.27 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  36.92 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  36.09 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  35.14 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  33.59 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  36.09 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  36.09 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  36.11 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  36.92 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  35.11 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  32.88 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  29.37 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  29.37 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  32.33 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  32.19 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  30.83 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  29.73 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  33.11 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  31.51 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  32.03 
 
 		 177 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  33.11 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  33.11 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  35.04 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  35.04 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  32.28 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  32.81 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  32.59 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  31.5 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  31.91 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  31.82 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  34.81 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  30.15 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  34.45 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  34.07 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  34.07 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  32.03 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  32.89 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  29.86 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  34.86 
 
 		 176 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  32.59 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  27.33 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  29.25 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  30.87 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  27.27 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  31.16 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  31.16 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  28.35 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  33.81 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  31.71 
 
 		 315 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  30.66 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  31.91 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  29.71 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  26.43 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  28.17 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  28.17 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  30.89 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  32.23 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  30.89 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  26.62 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  30.41 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  36.78 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  30.41 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  29.53 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  30.41 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  27.7 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  30.07 
 
 		 320 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  29.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  30.15 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  27.2 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  29.55 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2053  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000505775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1726  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  29.55 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>