100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3996 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 163 aa  320  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  42.86 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  31.94 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  34.29 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  30.28 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  34.75 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  32.86 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  30.37 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  29.86 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  33.83 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  32.14 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  30.43 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  31.94 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  36.81 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  34 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  27.94 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  30.22 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  26.52 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  28.77 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  32.33 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  29.79 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  27.74 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  29.93 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  27.97 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  32.37 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  27.86 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  29.13 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  27.01 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  27.86 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  33.91 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  36.21 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  26.76 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  33.58 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  31.33 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  30.94 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  29.29 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  29.69 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  33.59 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  29.79 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  30.22 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  31.51 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  24.82 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  28.99 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  29.2 
 
 		 315 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  30.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  31.51 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  30.16 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  26.47 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  31.51 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  28.66 
 
 		 318 aa  51.2  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  28.47 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  25.56 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  30.83 
 
 		 317 aa  50.8  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  29.1 
 
 		 305 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  30.71 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  27.34 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  27.34 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  30.22 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  27.34 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  29.93 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  27.18 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3471  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  26.87 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  26.56 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  29.58 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  28.46 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  30.89 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  25.4 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  28.47 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  25.74 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  29.2 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  29.77 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  26.47 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  38.24 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  31.54 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  26.79 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3511  hypothetical protein  28.47 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3256  hypothetical protein  28.47 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0243517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3166  membrane-spanning protein  28.47 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  24 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  27.94 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  23.58 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  23.61 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  27.27 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  22.83 
 
 		 151 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  27.34 
 
 		 177 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  30.43 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  26.76 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  27.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  27.74 
 
 		 313 aa  40.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  27.74 
 
 		 313 aa  40.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>