94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3765 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  287  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  64.86 
 
 		 183 aa  189  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  65.75 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  63.76 
 
 		 154 aa  187  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  63.09 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  62.24 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  61.54 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  62.5 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  60.84 
 
 		 149 aa  176  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  59.06 
 
 		 160 aa  156  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  42.22 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  37.14 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  36.76 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  36.03 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  37.6 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  30.6 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  34.29 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  37.84 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1328  hypothetical protein  35.46 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  33.59 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0049  hypothetical protein  34.75 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0539536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  30.99 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  34.03 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  38.64 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  36.62 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  28.29 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  30.15 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  39.13 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  37.59 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  29.63 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  29.13 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  32.45 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  26.15 
 
 		 297 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  33.8 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  35.54 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  33.59 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  31.33 
 
 		 318 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  33.61 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  27.64 
 
 		 309 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  27.64 
 
 		 309 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  33.1 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  25.17 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  33.87 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  36.62 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  30.08 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  33.86 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  30.3 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  30.94 
 
 		 307 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  31.25 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  26.15 
 
 		 305 aa  50.4  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  29.85 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  30.25 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  22.22 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  30.71 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  30.61 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2369  hypothetical protein  23.02 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2963  hypothetical protein  23.02 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.41688  normal  0.045431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  27.97 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  26.57 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  32.09 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  31.37 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  28.91 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  31.37 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  35.34 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  32.17 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2213  hypothetical protein  21.43 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  31.65 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  27.66 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  25.95 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  27.91 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  25.74 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  28 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  29.51 
 
 		 151 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  30.38 
 
 		 148 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3483  hypothetical protein  25.9 
 
 		 154 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  36.62 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0520  protein of unknown function DUF606  23 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000146462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3464  hypothetical protein  25.9 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.060266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3472  hypothetical protein  26.09 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2420  hypothetical protein  20.63 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  36.62 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  29.66 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3230  hypothetical protein  26.09 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000207849  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  32.82 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  36.62 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  31.15 
 
 		 147 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>