128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0091 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  290  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  63.51 
 
 
148 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  64.93 
 
 
148 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  49.3 
 
 
147 aa  144  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  51.37 
 
 
147 aa  143  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  54.93 
 
 
143 aa  140  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  50.68 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  32.09 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  31.76 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  32.81 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  30.56 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  33.1 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  32.09 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  32.14 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  29.45 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  30.94 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  30.94 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  33.58 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  30.88 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2936  hypothetical protein  32.31 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2619  hypothetical protein  32.31 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  30.22 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  30.47 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  36.28 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  37.17 
 
 
178 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  30.09 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  29.55 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1952  hypothetical protein  30.07 
 
 
145 aa  60.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00709257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  30.95 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  29.5 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  30.94 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  30.16 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  30.3 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  30.94 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0867  protein of unknown function DUF606  24.26 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  30.7 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  29.5 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2367  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2418  hypothetical protein  26.67 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2211  hypothetical protein  27.14 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.309526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  34.4 
 
 
149 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2965  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108015  normal  0.0601681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  30.07 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  25.17 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  30 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  32.33 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  28.86 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  29.85 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  29.53 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  26.47 
 
 
148 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  29.2 
 
 
151 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  32.33 
 
 
147 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  31.13 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2963  hypothetical protein  27.56 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.41688  normal  0.045431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  30.33 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  28.17 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  26.56 
 
 
386 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2213  hypothetical protein  27.27 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  25.93 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  28.26 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  29.53 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  27.56 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  24.46 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  32.11 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  27.13 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  31.62 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2369  hypothetical protein  26.77 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  27.97 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  25.2 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3471  hypothetical protein  25.2 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2420  hypothetical protein  26.77 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  25.2 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  30.08 
 
 
152 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  28.87 
 
 
153 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  24.41 
 
 
140 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  25.2 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3256  hypothetical protein  24.41 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0243517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3166  membrane-spanning protein  24.41 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.590312  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  26.92 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3511  hypothetical protein  24.41 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  28.17 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  23.62 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  45.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  27.7 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  30.99 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  23.62 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  29.23 
 
 
315 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  26.81 
 
 
177 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3456  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0521  protein of unknown function DUF606  23.19 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00661501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  26.27 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  26.27 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  23.97 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  25.55 
 
 
317 aa  44.3  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  23.13 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  26.27 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3164  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3464  hypothetical protein  27.68 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.060266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>