104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3901 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  100 
 
 		 147 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  99.32 
 
 		 147 aa  268  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  94.56 
 
 		 147 aa  223  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  54.42 
 
 		 147 aa  147  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  57.14 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  54.79 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  52.38 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  54.42 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  48.98 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  42.54 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  41.79 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  41.04 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  41.1 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  39.73 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  36.88 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  42.64 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  39.26 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  35.81 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  36.88 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  39.86 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  34.06 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  29.37 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  44.36 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  36.96 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  34.97 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  34.75 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  35.17 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  35.04 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  37.6 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  34.59 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  36.8 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  33.57 
 
 		 318 aa  66.6  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  34.97 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  34.75 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  33.57 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  34.97 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  37.6 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  31.69 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  30.99 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  34.72 
 
 		 320 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  31.21 
 
 		 317 aa  63.9  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  33.81 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  37.86 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  34.72 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  34.72 
 
 		 313 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  34.65 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  37.78 
 
 		 315 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  36.43 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  36.43 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  36.43 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  40 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  33.07 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  30.43 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  32.2 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  33.81 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  31.3 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  34.83 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  35.14 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  30.37 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  38.82 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  33.86 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  29.5 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  33.8 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  32.59 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  32.33 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  28.37 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  32.09 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  34.56 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  28.87 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  28.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  32.8 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  29.71 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  30.47 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  28.45 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  27.78 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  27.34 
 
 		 297 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  26.39 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  26.39 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  31.71 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  33.58 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  31.91 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  29.32 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  29.32 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  29.32 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  28.92 
 
 		 323 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  28.92 
 
 		 322 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  28.92 
 
 		 323 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  28.92 
 
 		 323 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  28.92 
 
 		 323 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  32.86 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  29.32 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>