93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4213 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  275  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  97.97 
 
 		 148 aa  270  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  84.35 
 
 		 147 aa  221  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  61.9 
 
 		 147 aa  153  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  58.22 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  54.79 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  54.79 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  53.47 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  51.49 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  45.26 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  44.06 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  44.06 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  41.73 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  38.57 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  38.46 
 
 		 174 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  39.13 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  42.31 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  39.72 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  37.24 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  36.3 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  42.65 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  43.15 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  43.57 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  37.41 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  37.32 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  37.41 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  35.66 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  36.43 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  36.62 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  33.81 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  39.01 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  34.51 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  38.46 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  31.03 
 
 		 178 aa  67  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  33.1 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  33.1 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  36.69 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  33.09 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  36.5 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  35.66 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  46.05 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  42.35 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  41.57 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  39.33 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  36.61 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  39.77 
 
 		 315 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  44.74 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  41.18 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  33.09 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  35.2 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  35.43 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  44.74 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  35.16 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  34.78 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  44.74 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  33.1 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  30.94 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  38.2 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  34.96 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  35.46 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  30.28 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  35.46 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  34.75 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  34.75 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  32.19 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  33.09 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  35.66 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  35.92 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  35.92 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  30.83 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  27.46 
 
 		 307 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  32.19 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  34.94 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  30.88 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  28.45 
 
 		 321 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  31.45 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  27.59 
 
 		 323 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  27.59 
 
 		 323 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  27.59 
 
 		 323 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  27.59 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  27.59 
 
 		 323 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  30.99 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  23.49 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  23.49 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2369  hypothetical protein  24.14 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2420  hypothetical protein  22.07 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>