123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1140 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  287  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  51.37 
 
 
148 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  45.89 
 
 
148 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  47.55 
 
 
143 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  43.36 
 
 
147 aa  120  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  43.15 
 
 
147 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  31.85 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2936  hypothetical protein  39.2 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2619  hypothetical protein  38.4 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  35.29 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  32.09 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  32.37 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  31.34 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  31.72 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  30 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  33.03 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1952  hypothetical protein  29.1 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00709257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  32.62 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  29.79 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0867  protein of unknown function DUF606  27.86 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  32.86 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  33.64 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2213  hypothetical protein  29.5 
 
 
156 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2418  hypothetical protein  29.55 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  28.46 
 
 
315 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  29.03 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  28.78 
 
 
184 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  29.2 
 
 
172 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2963  hypothetical protein  30.15 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.41688  normal  0.045431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2367  hypothetical protein  31.34 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2211  hypothetical protein  30.3 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.309526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  30.77 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2369  hypothetical protein  28.99 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  30.77 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  31.4 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  31.36 
 
 
178 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  32.76 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  30.51 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2965  hypothetical protein  30.6 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108015  normal  0.0601681 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  29.53 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  32.03 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  28.15 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  33.08 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  28.15 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  35.45 
 
 
163 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  29.1 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  34.07 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  27.4 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  28.08 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  27.69 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  30.88 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2420  hypothetical protein  28.26 
 
 
157 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  25.56 
 
 
307 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  31.06 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  32.23 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  25.93 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  28.91 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3167  hypothetical protein  28.83 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  28.68 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3483  hypothetical protein  28.83 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3456  hypothetical protein  28.83 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  27.66 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  32.14 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  23.4 
 
 
317 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  28.28 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  28 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3257  hypothetical protein  28.83 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3230  hypothetical protein  28.83 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000207849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3512  hypothetical protein  28.83 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  28.87 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3472  hypothetical protein  28.83 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  26.95 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  29.46 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  26.06 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  24.09 
 
 
147 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  29.13 
 
 
162 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  31.43 
 
 
149 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3464  hypothetical protein  27.93 
 
 
154 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.060266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3164  hypothetical protein  28.83 
 
 
154 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  30.23 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  26.71 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  32.43 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  26.36 
 
 
172 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  22.48 
 
 
146 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  32.43 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1792  hypothetical protein  27.93 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  28.8 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  25.68 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  32.74 
 
 
333 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  28.92 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0102673 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>