146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0202 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  100 
 
 
142 aa  271  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  45.26 
 
 
145 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  40.43 
 
 
146 aa  104  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  44.53 
 
 
145 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  45.32 
 
 
145 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  39.01 
 
 
144 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  38.57 
 
 
163 aa  97.1  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  36.69 
 
 
183 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  36.51 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  43.07 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  36.51 
 
 
149 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  37.4 
 
 
149 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  38.46 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  35.71 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  34.78 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  37.93 
 
 
148 aa  87.4  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  39.17 
 
 
160 aa  87  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  35.71 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  43.17 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  32.54 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  80.1  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  31.47 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  34.23 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  41.94 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  29.79 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  39.44 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  35.29 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  35.83 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  37.01 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  30.56 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  35.56 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  30.6 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  34.69 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  30.71 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  36.88 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  31.58 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  35.56 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  29.5 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  33.09 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  33.61 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  39.74 
 
 
184 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  36.45 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  32.86 
 
 
305 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  32.64 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  32.12 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  30.22 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  33.02 
 
 
317 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  29.41 
 
 
164 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  33.71 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  32.39 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  33.09 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  33.9 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  29.71 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  37.38 
 
 
170 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  32.17 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  29.5 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  37.38 
 
 
178 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1952  hypothetical protein  28.79 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00709257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  30.5 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  35.71 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  28.99 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  32.06 
 
 
297 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  29.6 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  28.99 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  28.46 
 
 
309 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  28.46 
 
 
309 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  31.62 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  32.35 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  29.1 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  32.58 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  28.36 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  29.1 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  30.61 
 
 
148 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  34.62 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  30.88 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  29.66 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  35.9 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  35.9 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  30.5 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  30.66 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  29.55 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  30.3 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  35.9 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  27.21 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  29.73 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  29.93 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  29.85 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  26.76 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  34.81 
 
 
333 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2418  hypothetical protein  24.43 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  28.15 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  26.67 
 
 
140 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  26.67 
 
 
140 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>