177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6145 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  76.64 
 
 
148 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  81.76 
 
 
148 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  84.06 
 
 
148 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  79.69 
 
 
148 aa  183  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  52.9 
 
 
146 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  50.35 
 
 
147 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  49.65 
 
 
167 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  49.65 
 
 
147 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  51.82 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  48.74 
 
 
170 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  41.3 
 
 
162 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  40.54 
 
 
172 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  40 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  43.8 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  39.86 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  36.88 
 
 
174 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  35 
 
 
178 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  40.31 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  42.86 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  38.1 
 
 
176 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  40.16 
 
 
172 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  34.33 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  33.57 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  39.44 
 
 
184 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  43.88 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  38.58 
 
 
172 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  47.78 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  34.69 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  37.12 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  35.25 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  37.12 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  42.2 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  36.36 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  38.13 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  33.09 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  40.58 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  41.27 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  36.43 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  39.42 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  36.3 
 
 
315 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  37.41 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  32.12 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  34.81 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  38.52 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  34.4 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  32.88 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.23 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  30.66 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  36.69 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  35.97 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  33.81 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  27.64 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  33.81 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  31.58 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  31.34 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  36.88 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  29.5 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  31.86 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  31.16 
 
 
307 aa  64.7  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  34.07 
 
 
320 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  29.79 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  33.09 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  30.08 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  31.65 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  29.5 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  34.29 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  36.21 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  31.67 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  33.58 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  32.59 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  32.59 
 
 
313 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  32.84 
 
 
305 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  28.99 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  34.57 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  30.71 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  32.62 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  30.61 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  26.87 
 
 
309 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  26.87 
 
 
309 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  29.23 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  29.46 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3257  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3230  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000207849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3167  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3512  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  53.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3456  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3472  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3464  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.060266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  28.29 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3483  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1792  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  27.34 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>