71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0370 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  321  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3799  hypothetical protein  94.48 
 
 		 163 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000162069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2132  protein of unknown function DUF606  48.65 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.947377  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6654  protein of unknown function DUF606  41.61 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776475  normal  0.0686008 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5702  hypothetical protein  44.3 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2291  hypothetical protein  43.88 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1691  hypothetical protein  38.67 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.119542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  30.34 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0521  protein of unknown function DUF606  24.49 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00661501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  29.14 
 
 		 386 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  30.99 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  27.56 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  31.68 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  35 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  35 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  29.05 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  28.29 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  29.77 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  29.05 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  32.48 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  32.79 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  29.01 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  27.94 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  28.38 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  37.66 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  26 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  30.89 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  35.9 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  28.93 
 
 		 318 aa  45.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  32.52 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  37.66 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  29.08 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  24.53 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  32.31 
 
 		 164 aa  43.9  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  27.66 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  28.37 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  29.2 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  27.27 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  28.28 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  24.68 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  28.76 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  26.75 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  28.76 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  28.57 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  28.75 
 
 		 149 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  27.66 
 
 		 140 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3471  hypothetical protein  27.66 
 
 		 140 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  30.65 
 
 		 140 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  30.86 
 
 		 151 aa  42  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  27.66 
 
 		 140 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  39.76 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  28.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  27.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  26.19 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  27.66 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  28.48 
 
 		 143 aa  40.8  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  30.12 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3166  membrane-spanning protein  29.84 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.590312  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3511  hypothetical protein  29.84 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3256  hypothetical protein  29.84 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0243517  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  28.1 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  27.87 
 
 		 317 aa  40.4  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>