112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5052 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  100 
 
 		 147 aa  283  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  95.92 
 
 		 147 aa  263  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  95.24 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  45.99 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  51.09 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  47.45 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  47.48 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  47.83 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  42.65 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  42.65 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  43.57 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  45.39 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  43.84 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  36.55 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  40 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  36.36 
 
 		 147 aa  85.9  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  36.62 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  33.78 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  38 
 
 		 315 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  40 
 
 		 320 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  37.41 
 
 		 176 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  36.03 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  35.77 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  32.62 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  37.59 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  34.88 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  38.62 
 
 		 313 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  38.62 
 
 		 313 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  37.5 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  34.56 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  36.57 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  34.27 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  34.27 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  34.56 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  38.66 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  45.45 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  33.1 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  33.86 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  32.59 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  30.88 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  37.3 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  32.06 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  31.97 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  37.1 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  37.14 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  32.54 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  34.13 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  34.31 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  40.51 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  34.59 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  34.31 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  31.75 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  29.41 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  32.21 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  33.58 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  33.58 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  41.33 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  31.75 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  28.8 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  28.91 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  35 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  32.31 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  28.99 
 
 		 317 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  32.41 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  39.47 
 
 		 176 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  32.28 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  28 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  27.41 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  30.56 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  25.17 
 
 		 307 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  30.23 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  29.93 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  30.6 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  29.85 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  27.97 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  31.3 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  30.08 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.56 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  28.7 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  32 
 
 		 297 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  33.82 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  31.39 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  25.34 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  29.76 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  26.83 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6497  protein of unknown function DUF606  34.23 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  26.26 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  26.12 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  27.54 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  33.96 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  24.44 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  30.71 
 
 		 148 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  27.14 
 
 		 323 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  27.14 
 
 		 323 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  27.14 
 
 		 323 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  27.14 
 
 		 323 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>