111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4999 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  100 
 
 		 147 aa  283  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  99.32 
 
 		 147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  95.24 
 
 		 147 aa  263  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  46.72 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  51.09 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  49.28 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  45.26 
 
 		 177 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  46.76 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  45 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  41.18 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  41.18 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  44.22 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  42.76 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  37.41 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  39.26 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  36.62 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  42.52 
 
 		 315 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  37.32 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  40 
 
 		 320 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  33.78 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  41.18 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  35.77 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  39.31 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  39.31 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  34.04 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  43.53 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  36.73 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  34.88 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  43.53 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  45.35 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  33.57 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  33.57 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  34.97 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  46.75 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  33.82 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  33.1 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  32.79 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  32.81 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  35.61 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  35 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  29.77 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  33.82 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  36.29 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  36.11 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  33.57 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  32.54 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  41.33 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  27.94 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  29.6 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  43.37 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  32.54 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  31.13 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  41.33 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  26.47 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  27.94 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  29.2 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  29.29 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  30.16 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  39.47 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  39.74 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  34.17 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  31.5 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  25.5 
 
 		 307 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  28.15 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  30.66 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  30.6 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  32.43 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  30.34 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  27.2 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  29.85 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  36.23 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  29.46 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.34 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  30.89 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  32.33 
 
 		 333 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  31.4 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  28.26 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  28.26 
 
 		 322 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  28.26 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  28.26 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  28.26 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  29.27 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  37.74 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  28.36 
 
 		 321 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  26.87 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  32.79 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  31.17 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  32.79 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  27.83 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>