66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0371 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  96.73 
 
 		 153 aa  294  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2131  protein of unknown function DUF606  46.15 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5701  hypothetical protein  38.3 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  37.5 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  30.3 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2290  hypothetical protein  38.41 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3164  hypothetical protein  27.74 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3456  hypothetical protein  26.45 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1792  hypothetical protein  26.45 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3483  hypothetical protein  26.28 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3167  hypothetical protein  26.92 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1952  hypothetical protein  28.86 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00709257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3464  hypothetical protein  25.81 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.060266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3472  hypothetical protein  26.28 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3230  hypothetical protein  26.28 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000207849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  34.58 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  31.06 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3512  hypothetical protein  26.28 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3257  hypothetical protein  26.28 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2418  hypothetical protein  26.09 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  32.85 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  28.28 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2367  hypothetical protein  26.09 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  32.04 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  27.66 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  28.17 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  31.03 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  33.91 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  31.19 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  30.61 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2965  hypothetical protein  24.64 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108015  normal  0.0601681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  32.17 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  28.37 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  28.68 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0520  protein of unknown function DUF606  33.02 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000146462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2211  hypothetical protein  26.85 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.309526  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  29.27 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  32.24 
 
 		 315 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  29.25 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  28.32 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0521  protein of unknown function DUF606  26.15 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00661501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  27.73 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  27.21 
 
 		 333 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  32.14 
 
 		 316 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  28.32 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  31.11 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  32.43 
 
 		 148 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  29.41 
 
 		 335 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  28.68 
 
 		 317 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  26.21 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  35.25 
 
 		 318 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  35.44 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  24.17 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  28.28 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5702  hypothetical protein  31.78 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  30.23 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  25.69 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3471  hypothetical protein  23.85 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  23.85 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  23.85 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>