69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1952 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1952  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  281  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00709257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2936  hypothetical protein  45.52 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2619  hypothetical protein  45.52 
 
 
143 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0867  protein of unknown function DUF606  30.71 
 
 
144 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  34.59 
 
 
143 aa  76.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2369  hypothetical protein  33.1 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2963  hypothetical protein  32.39 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.41688  normal  0.045431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  33.58 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2420  hypothetical protein  32.39 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2213  hypothetical protein  33.1 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  29.1 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  31.39 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  30.07 
 
 
148 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2418  hypothetical protein  29.58 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2367  hypothetical protein  28.87 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  28.86 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  28.86 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2965  hypothetical protein  28.87 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108015  normal  0.0601681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  26.87 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  30.3 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  26.39 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  26.39 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  28.79 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  28.57 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  27.27 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  30 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2211  hypothetical protein  26.06 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.309526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  30.6 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  30.71 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  25.74 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  28.12 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  29.46 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  26.47 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  26.19 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  30.43 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  30.58 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  28.89 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  30.43 
 
 
315 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  22.79 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  24.63 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  28.06 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3471  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  28.68 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0521  protein of unknown function DUF606  25.37 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00661501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  28.46 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  35.21 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3256  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0243517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3166  membrane-spanning protein  28.68 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.590312  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3511  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  28.68 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  26.47 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  28.91 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  28.91 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  27.21 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  28.91 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  25.37 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  27.91 
 
 
154 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  27.21 
 
 
147 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  33.8 
 
 
148 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  26.19 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3945  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.73 
 
 
452 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  28.41 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  25.36 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  26.36 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  28.12 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>