47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1900 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  268  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1444  hypothetical protein  48.03 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00624852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  29.73 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0166  hypothetical protein  29.46 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  32.18 
 
 
590 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0496  hypothetical protein  25 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  27.13 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  25.93 
 
 
270 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0964  putative thioredoxin  28.8 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00015819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27 
 
 
406 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  25.64 
 
 
596 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  27.62 
 
 
274 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  26.56 
 
 
391 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  29.55 
 
 
179 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2735  hypothetical protein  24.75 
 
 
194 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134896  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  25.93 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  26.8 
 
 
661 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  26.79 
 
 
644 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  25 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0266  hypothetical protein  28.81 
 
 
125 aa  43.5  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  25.36 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  29.79 
 
 
643 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  30.12 
 
 
522 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  30.12 
 
 
522 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  30.12 
 
 
522 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  30.12 
 
 
522 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  30.12 
 
 
522 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  30.12 
 
 
522 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  30.12 
 
 
522 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2187  hypothetical protein  31.34 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.408924  normal  0.201272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  31.34 
 
 
684 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  24.59 
 
 
321 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  29 
 
 
569 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  26.26 
 
 
217 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1583  hypothetical protein  21.57 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  23.33 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1409  protein of unknown function DUF255  31.33 
 
 
581 aa  41.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  35.19 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  31.03 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  25.81 
 
 
675 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  25 
 
 
737 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  27.55 
 
 
197 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  22.02 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  26.09 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  29.85 
 
 
733 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  25.76 
 
 
342 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  25.81 
 
 
693 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>