More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1815 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1815  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
502 aa  994    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000937522  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0151  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  57.49 
 
 
494 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000123394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1516  NADH dehydrogenase subunit N  52.21 
 
 
496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.858529  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0194  NADH dehydrogenase subunit N  51.23 
 
 
486 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1669  NADH dehydrogenase subunit N  49.7 
 
 
496 aa  478  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1432  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  36.78 
 
 
465 aa  266  7e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.88 
 
 
487 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.85 
 
 
491 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.02 
 
 
489 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.1 
 
 
487 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.37 
 
 
484 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.65 
 
 
484 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.92 
 
 
484 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1917  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  35.39 
 
 
462 aa  239  9e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.787882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  33.56 
 
 
484 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  39.31 
 
 
519 aa  237  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1551  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  35.51 
 
 
462 aa  236  7e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0733202  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1737  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  34.63 
 
 
462 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.32 
 
 
483 aa  229  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  34.39 
 
 
479 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  32.96 
 
 
480 aa  223  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  31.68 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.24 
 
 
492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  36.99 
 
 
478 aa  220  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  32.23 
 
 
478 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  31.57 
 
 
478 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.11 
 
 
498 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.02 
 
 
481 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.35 
 
 
482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  33.76 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  33.76 
 
 
478 aa  213  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  34.02 
 
 
478 aa  213  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.5 
 
 
479 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.72 
 
 
479 aa  213  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.72 
 
 
479 aa  213  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.26 
 
 
479 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.97 
 
 
477 aa  210  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  31.18 
 
 
525 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  30.26 
 
 
478 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  35.55 
 
 
492 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0714  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.04 
 
 
503 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.760446  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.61 
 
 
516 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  35.84 
 
 
485 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.02 
 
 
457 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.94 
 
 
505 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  35.61 
 
 
479 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  32.49 
 
 
493 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  34.32 
 
 
490 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  29.76 
 
 
479 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.87 
 
 
511 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.28 
 
 
498 aa  206  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  34.32 
 
 
490 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.38 
 
 
482 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  35.26 
 
 
490 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  35.26 
 
 
485 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  35.26 
 
 
490 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  35.26 
 
 
490 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  35.26 
 
 
490 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  33.24 
 
 
524 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  35.26 
 
 
485 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  35.26 
 
 
485 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  31.88 
 
 
494 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  36.31 
 
 
489 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  37.46 
 
 
487 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.36 
 
 
467 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  33.63 
 
 
524 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  33.63 
 
 
524 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.75 
 
 
475 aa  203  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  36.31 
 
 
488 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  33.93 
 
 
527 aa  203  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  36.31 
 
 
488 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  33.77 
 
 
487 aa  203  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  36.02 
 
 
488 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.86 
 
 
477 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  33.86 
 
 
511 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  36.02 
 
 
488 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  36.02 
 
 
488 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  33.33 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  31.26 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  33.63 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  33.89 
 
 
557 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.48 
 
 
521 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  30.88 
 
 
517 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.09 
 
 
506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.50446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  32.67 
 
 
485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  33.72 
 
 
531 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2703  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36 
 
 
565 aa  200  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  30.67 
 
 
517 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.13 
 
 
464 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.05 
 
 
500 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  32.71 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1267  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.68 
 
 
516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  30.91 
 
 
481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.68 
 
 
516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.3 
 
 
511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  32.82 
 
 
485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  30.86 
 
 
482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  30.63 
 
 
482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  35.41 
 
 
479 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.99 
 
 
476 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>