More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1557 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  100 
 
 
543 aa  1112    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  55.13 
 
 
546 aa  579  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  54.12 
 
 
553 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0571  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.13 
 
 
509 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.337724  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1293  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.32 
 
 
509 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1174  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.32 
 
 
509 aa  484  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.630806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.51 
 
 
554 aa  480  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.65 
 
 
529 aa  476  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0470  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.65 
 
 
510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  51.63 
 
 
526 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  50.37 
 
 
572 aa  300  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1826  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.29 
 
 
893 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2361  DNA-directed DNA polymerase  52.29 
 
 
957 aa  296  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832917  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  54.37 
 
 
696 aa  295  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2219  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47 
 
 
812 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.13 
 
 
1040 aa  293  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2206  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47 
 
 
826 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.97 
 
 
914 aa  292  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.31 
 
 
1045 aa  292  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1361  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47 
 
 
825 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.926406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0951  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.33 
 
 
793 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127107  normal  0.667155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.68 
 
 
911 aa  292  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2373  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47 
 
 
822 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.74 
 
 
582 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0045  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47 
 
 
825 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47 
 
 
825 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47 
 
 
825 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0281713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.9 
 
 
1071 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.2 
 
 
793 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51542  normal  0.226661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1446  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.32 
 
 
821 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223161  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5128  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.2 
 
 
791 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00417503  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6252  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.2 
 
 
787 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2244  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47 
 
 
825 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1827  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.2 
 
 
787 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  46.9 
 
 
1002 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1738  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.33 
 
 
813 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206235  normal  0.0482422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50 
 
 
579 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1765  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.33 
 
 
824 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50 
 
 
582 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.79 
 
 
582 aa  290  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  46.55 
 
 
955 aa  289  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.55 
 
 
1137 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50 
 
 
579 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.48 
 
 
551 aa  289  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.38 
 
 
591 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.75 
 
 
685 aa  289  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.95549  normal  0.915026 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1055  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  48.75 
 
 
631 aa  288  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0820336  normal  0.461674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.01 
 
 
690 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.22 
 
 
587 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.21 
 
 
1115 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.55 
 
 
957 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.86 
 
 
1137 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.51 
 
 
569 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.74 
 
 
601 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.74 
 
 
601 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.52 
 
 
1147 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  49.64 
 
 
579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.52 
 
 
637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.7 
 
 
921 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.17 
 
 
939 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.69 
 
 
751 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325473  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.55 
 
 
948 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.05 
 
 
774 aa  282  9e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  49.43 
 
 
537 aa  282  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  47.81 
 
 
580 aa  282  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.08 
 
 
614 aa  282  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.24 
 
 
694 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.42 
 
 
667 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3744  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  46.52 
 
 
715 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1085  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.85 
 
 
714 aa  280  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.39 
 
 
606 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.01 
 
 
795 aa  280  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.45 
 
 
606 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.83 
 
 
743 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2112  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.01 
 
 
730 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.64 
 
 
752 aa  279  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.15 
 
 
687 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.15 
 
 
691 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.83 
 
 
736 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.15 
 
 
689 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.89 
 
 
553 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.15 
 
 
692 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1976  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.99 
 
 
650 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0621035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4903  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.67 
 
 
731 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742776  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.18 
 
 
696 aa  278  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.18 
 
 
692 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.46 
 
 
643 aa  277  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.46 
 
 
643 aa  277  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.46 
 
 
643 aa  277  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.46 
 
 
643 aa  277  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.46 
 
 
643 aa  277  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.15 
 
 
723 aa  277  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1670  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.6 
 
 
605 aa  277  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.595012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  52.46 
 
 
643 aa  277  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.52 
 
 
681 aa  276  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.46 
 
 
643 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.53 
 
 
642 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.46 
 
 
643 aa  277  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.46 
 
 
643 aa  277  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0544  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.53 
 
 
642 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>