295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1371 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1371  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  799    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0809978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0111  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1627  major facilitator transporter  44.97 
 
 
398 aa  350  2e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000293594  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1522  putative methionyl-tRNA formyltransferase  43.64 
 
 
398 aa  344  1e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0511  transporter, putative  42.2 
 
 
395 aa  339  5e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1478  putative transporter  41.94 
 
 
395 aa  338  9e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.766379  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0486  transporter, putative  41.94 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  42.78 
 
 
397 aa  329  7e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0804  putative integral membrane protein  42.35 
 
 
397 aa  315  9e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000430174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.5 
 
 
424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  21.25 
 
 
426 aa  96.3  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  24.11 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  27.55 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  22.87 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  21.19 
 
 
450 aa  76.3  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  26.18 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  27.89 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  28.23 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  28.23 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  26.43 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  28.23 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.44 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  21.89 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.19 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.89 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  27.55 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  27.89 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  23.33 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  27.89 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  20.99 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  28.23 
 
 
422 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  27.61 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  20.77 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  21.62 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  20.63 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  21.48 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  25.98 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  20.51 
 
 
1816 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  25 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  20.33 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  27.5 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2647  macrolide efflux protein  22.5 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  22.59 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  23.74 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2945  putative transporter  22.33 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000764756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  24.27 
 
 
434 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  24.27 
 
 
434 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2935  transporter, putative  22.33 
 
 
400 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00291638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2624  macrolide efflux protein  22.01 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2633  putative permease  28.03 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.778605  hitchhiker  0.00000416081 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2897  putative transporter  22.01 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000603201 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  22.28 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  24 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  23.73 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.58 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  22.28 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2334  putative transporter  21.38 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.609115  hitchhiker  0.000374493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  21.84 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2912  putative transporter  21.38 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  20.96 
 
 
413 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  21.13 
 
 
445 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  20.96 
 
 
413 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  22.93 
 
 
426 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  21.41 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  25.53 
 
 
431 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  22.63 
 
 
686 aa  63.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  22.4 
 
 
425 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  22.77 
 
 
415 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  26.43 
 
 
414 aa  63.2  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2698  transporter  21.7 
 
 
400 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2896  transporter  21.7 
 
 
400 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550762  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  22.4 
 
 
425 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  22.41 
 
 
416 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  23.56 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  22.39 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  26.25 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  26.25 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.33 
 
 
524 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  26.25 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  26.25 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  26.25 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  20.62 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  19.26 
 
 
450 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  27.68 
 
 
432 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  17.93 
 
 
1833 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  25.62 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  21.41 
 
 
457 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  19 
 
 
1829 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  23.27 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2128  hypothetical protein  23.32 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  22.19 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  25.45 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  18.64 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>