93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3249 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3249  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 229 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64355  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3476  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  92.04 
 
 		 228 aa  362  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.4 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.662517  hitchhiker  0.00035303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3295  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.33 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.31 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346062  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4986  hypothetical protein  39.53 
 
 		 177 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207268  normal  0.0734509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3226  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.7 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4950  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.63 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000101187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.62 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.94 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.84 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.95 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  35.37 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  38.58 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.57 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.97 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  37.63 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.73 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.55 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.89 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.74 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.7 
 
 		 428 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.97 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.97 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.97 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  32.39 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.36 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  36.05 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 163 aa  52  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.65 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.32 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14950  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.81 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.33 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.34 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.52 
 
 		 165 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.33 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.55 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.16 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.17 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.68 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.8 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.16 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.38 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3064  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.27 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097831  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.61 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  38.26 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.34 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.18 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  31.46 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  31.46 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.84 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.3 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.41 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.08 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.08 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.08 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.37 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.08 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.08 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.08 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.29 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.52 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.23 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.3 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.08 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.92 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1608  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.9 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00805747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.82 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1928  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  33.77 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1646  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  33.77 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1225  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.29 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1803  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  31.97 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.674718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.96 
 
 		 428 aa  42  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0840  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.29 
 
 		 218 aa  42  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2145  phosphatidylglycerophosphate synthetase  38.24 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000741814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01866  hypothetical protein  38.24 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2684  phosphatidylglycerophosphate synthetase  38.24 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000482771  normal  0.0397863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1039  phosphatidylglycerophosphate synthetase  38.24 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.85781e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1271  phosphatidylglycerophosphate synthetase  38.24 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000101936  hitchhiker  0.00068056 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1727  phosphatidylglycerophosphate synthetase  38.24 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000137151  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01877  phosphatidylglycerophosphate synthetase  38.24 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000694411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2010  phosphatidylglycerophosphate synthetase  38.24 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8607999999999997e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1734  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  38.24 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.72822e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>