80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4950 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4950  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 244 aa  461  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000101187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.13 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.662517  hitchhiker  0.00035303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.46 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346062  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3249  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.84 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64355  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3476  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.54 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3295  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.88 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3226  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.77 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  0.0165303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.14 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.45 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.73 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  31.65 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.15 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.75 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.56 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.53 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.93 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.91 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.84 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.92 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.23 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.89 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.94 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.36 
 
 		 425 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.14 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.86 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.67 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.11 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  32.59 
 
 		 177 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.07 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.28 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.12 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.26 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  40 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.79 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  38.06 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.45 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.17 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.26 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  29.26 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.26 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  29.26 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.55 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.31 
 
 		 216 aa  48.9  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.72 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.46 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.48 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  25.74 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.33 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.14 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.73 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.52 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.8 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1218  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  32.2 
 
 		 188 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.3 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.93 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.29 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0818  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 		 184 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.259617  normal  0.0304131 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1132  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.94 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.5 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1257  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.94 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.56 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14950  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.28 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0608  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.94 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.09 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1340  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  36.76 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00208453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2945  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.29 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000877999  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00913  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase PIS (AFU_orthologue; AFUA_1G15790)  34.09 
 
 		 306 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.635906  normal  0.333499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  36.46 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3064  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.31 
 
 		 206 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097831  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.22 
 
 		 201 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  38.71 
 
 		 209 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  30.22 
 
 		 201 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  30.22 
 
 		 201 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>