54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3295 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3295  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 218 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.08 
 
 		 277 aa  141  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.662517  hitchhiker  0.00035303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3249  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.36 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64355  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3476  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.59 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346062  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3226  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.72 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4950  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.81 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000101187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.59 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.35 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  35.34 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.47 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.94 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.87 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.52 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  36.67 
 
 		 177 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4986  hypothetical protein  31.03 
 
 		 177 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207268  normal  0.0734509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.59 
 
 		 299 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.22 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.54 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.4 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.49 
 
 		 425 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.97 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.84 
 
 		 299 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.84 
 
 		 299 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.82 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.76 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.15 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.57 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.82 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.39 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.12 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.53 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.75 
 
 		 428 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39 
 
 		 163 aa  45.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.71 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.85 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.63 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.29 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.69 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.48 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.66 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  30.43 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  39.22 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  39.22 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  39.22 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.55 
 
 		 216 aa  42  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  33.1 
 
 		 217 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.87 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  35.86 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>