95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3226 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3226  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
238 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.13 
 
 
277 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.662517  hitchhiker  0.00035303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3295  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.63 
 
 
218 aa  118  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.2 
 
 
255 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346062  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3249  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.16 
 
 
229 aa  99  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64355  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3476  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.16 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.92 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  36.11 
 
 
193 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.5 
 
 
193 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.69 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.67 
 
 
425 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4950  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.49 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000101187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  39.41 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  39.41 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  39.41 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  37.16 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.99 
 
 
207 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.19 
 
 
202 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.33 
 
 
211 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.17 
 
 
199 aa  58.9  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.53 
 
 
211 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.05 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.48 
 
 
216 aa  58.5  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.43 
 
 
163 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.31 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.75 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.59 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.56 
 
 
190 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.56 
 
 
428 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.47 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.4 
 
 
193 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.73 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  31.22 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.96 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.42 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.21 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  35.48 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.15 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.75 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.27 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.32 
 
 
165 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.91 
 
 
205 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.46 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.16 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.93 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.69 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.77 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  38.06 
 
 
203 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.67 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.73 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2259  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.05 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0818  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.58 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.259617  normal  0.0304131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.79 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.92 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.9 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4986  hypothetical protein  30.07 
 
 
177 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207268  normal  0.0734509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.21 
 
 
205 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.26 
 
 
299 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.26 
 
 
299 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.46 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  35.96 
 
 
177 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.49 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.86 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.32 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.3 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.36 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.22 
 
 
218 aa  45.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1009  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  35.64 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.86 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0840  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.98 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14950  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.64 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.63 
 
 
499 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1734  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.96 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3064  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.07 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097831  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0012  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  33.93 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.02 
 
 
259 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1225  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.86 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
530 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2139  cdp-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferas (phosphatidylglycerophosphate synthase)  40.58 
 
 
184 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00838588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.85 
 
 
259 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 
316 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1906  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  48.98 
 
 
185 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.300559  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.54 
 
 
203 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.55 
 
 
226 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.6 
 
 
198 aa  42  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.55 
 
 
226 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>