More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2651 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
265 aa  490  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0793628  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  90.57 
 
 
265 aa  384  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 
284 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.124503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.366459  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
301 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.452805  hitchhiker  0.000000299864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
265 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
275 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.037184 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
262 aa  107  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
301 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
298 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
309 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.8 
 
 
303 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  32.74 
 
 
300 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
303 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
297 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
297 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  30.56 
 
 
303 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  30.56 
 
 
303 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  30.56 
 
 
303 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
288 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0996519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  30.56 
 
 
303 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  30.56 
 
 
303 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0952  glutathione transport system permease GsiD  31.03 
 
 
303 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0892  glutathione transport system permease protein GsiD  31.03 
 
 
303 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0981  glutathione transport system permease GsiD  31.03 
 
 
303 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
291 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1002  glutathione transport system permease GsiD  31.03 
 
 
303 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0919  glutathione transport system permease protein GsiD  31.03 
 
 
303 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285756  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30.16 
 
 
303 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
303 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  30.95 
 
 
297 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  30.16 
 
 
303 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 
283 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
283 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 
283 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
297 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  30.14 
 
 
283 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  30.86 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.14 
 
 
283 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
283 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.68 
 
 
283 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
297 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
275 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231444  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
297 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
297 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  30.86 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  29.63 
 
 
283 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  30.09 
 
 
283 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0155  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.59 
 
 
292 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238601  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16210  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.2 
 
 
278 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
292 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273251  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
283 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1601  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.71 
 
 
278 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
310 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.361284  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
301 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
313 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
271 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112929  normal  0.720106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
308 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  31.25 
 
 
299 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
291 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.532821  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
280 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2030  ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
300 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.749678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0251  peptide ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
292 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
308 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7518  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  33.33 
 
 
295 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
297 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 
301 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2385  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.11 
 
 
287 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1030  nickel transporter permease NikC  32.77 
 
 
270 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
301 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
294 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
287 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
296 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
294 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
283 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  30.51 
 
 
284 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
287 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120165  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3715  peptide ABC transporter membrane protein  36.49 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
469 aa  99.4  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1972  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  33.04 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000233159  normal  0.641101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
300 aa  99.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
300 aa  99.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726718  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
318 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.7223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
299 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.0228054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
275 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
299 aa  99  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>