More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2204 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2204  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 500 aa  1016    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0651857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8463  glutamine synthetase catalytic region  42.19 
 
 		 478 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3191  L-glutamine synthetase  41.63 
 
 		 500 aa  319  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0830  L-glutamine synthetase  38.31 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5153  L-glutamine synthetase  38.95 
 
 		 479 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  38.74 
 
 		 486 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  37.73 
 
 		 476 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6981  glutamine synthetase catalytic region  39.02 
 
 		 478 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  37.68 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2132  L-glutamine synthetase  35.53 
 
 		 498 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  35.64 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  31.08 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  31.05 
 
 		 463 aa  168  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  31.25 
 
 		 449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  28.86 
 
 		 476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  28.86 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3011  glutamate--ammonia ligase  31.05 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.858612  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  28.86 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2644  glutamate--ammonia ligase  32.24 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0972  glutamate--ammonia ligase  31 
 
 		 449 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  30.41 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  30.77 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1060  glutamate--putrescine ligase  29.98 
 
 		 449 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0974728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1121  glutamate--ammonia ligase  30.39 
 
 		 448 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  32.2 
 
 		 453 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  30.25 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  30.25 
 
 		 445 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2919  L-glutamine synthetase  30.75 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000934315  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3001  L-glutamine synthetase  30.75 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000079724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3098  L-glutamine synthetase  30.75 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1165  glutamate--putrescine ligase  30.46 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3193  Glutamate--putrescine ligase  30.46 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0866318  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1198  glutamate--putrescine ligase  30.46 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1107  glutamate--ammonia ligase  30.46 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000899819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1093  glutamate--ammonia ligase  30.75 
 
 		 451 aa  156  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  30.54 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  29.31 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1268  glutamine synthetase  30.75 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3032  glutamate--ammonia ligase  30.24 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  29.08 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  29.26 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  31.05 
 
 		 449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  30 
 
 		 449 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  33.11 
 
 		 444 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  29.89 
 
 		 456 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  31.3 
 
 		 455 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  30.47 
 
 		 452 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  30.43 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  29.68 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  28.93 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  33.11 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  29.8 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  29.68 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  28.48 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  29.8 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  30.25 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  31.17 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  30.25 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  30.25 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  30.11 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  29.89 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  33.11 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  30.24 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  28.48 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  28.97 
 
 		 490 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  29.8 
 
 		 445 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  29.8 
 
 		 445 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  29.89 
 
 		 452 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  30.47 
 
 		 452 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  29.8 
 
 		 445 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  30.25 
 
 		 452 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  29.89 
 
 		 452 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  29.89 
 
 		 452 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  28.88 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  31.25 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  30.02 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  30.25 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3517  glutamate--putrescine ligase  32.92 
 
 		 445 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0538  glutamate--putrescine ligase  30.27 
 
 		 446 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  31.37 
 
 		 456 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  29.8 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  30.54 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2226  glutamine synthetase family protein  31 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  29.37 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  29.6 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  29.8 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  29.8 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  30.39 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  30.08 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  26.27 
 
 		 439 aa  146  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  27.07 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  28.87 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  31.22 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  29.35 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  30.91 
 
 		 464 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  29.37 
 
 		 444 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  27.62 
 
 		 456 aa  143  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1397  glutamate--ammonia ligase  29.01 
 
 		 452 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34400  glutamine synthetase catalytic domain family protein  32.23 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1192  L-glutamine synthetase  30.62 
 
 		 455 aa  143  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>