More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2196 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 503 aa  998    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  57.2 
 
 		 486 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  55.94 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  50.69 
 
 		 503 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  50.41 
 
 		 492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  50 
 
 		 490 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  46.37 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  47.91 
 
 		 630 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  42.24 
 
 		 475 aa  309  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  42.48 
 
 		 479 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  42.22 
 
 		 475 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  42.54 
 
 		 477 aa  297  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  42.4 
 
 		 489 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  39.92 
 
 		 471 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  40.29 
 
 		 492 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  41.34 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  40.47 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  40.72 
 
 		 506 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  40.63 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  43 
 
 		 567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  40.85 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  39.35 
 
 		 473 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  39.35 
 
 		 473 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  39.35 
 
 		 473 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  40.08 
 
 		 497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  39.32 
 
 		 474 aa  266  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  39.17 
 
 		 488 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  40.28 
 
 		 496 aa  259  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  38.33 
 
 		 496 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  39.76 
 
 		 488 aa  256  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  38.21 
 
 		 489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  40.12 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  38.95 
 
 		 515 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  37.39 
 
 		 485 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  40.19 
 
 		 522 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  36.05 
 
 		 578 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.62 
 
 		 483 aa  232  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  35.94 
 
 		 486 aa  233  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  31.63 
 
 		 483 aa  228  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  37.58 
 
 		 477 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  37.25 
 
 		 508 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  36.22 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  34.47 
 
 		 519 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  38.03 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  33.83 
 
 		 515 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  35.67 
 
 		 478 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  39.38 
 
 		 487 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  37.14 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  34.12 
 
 		 478 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  34.12 
 
 		 478 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  34.01 
 
 		 509 aa  206  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  34.24 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  34.22 
 
 		 518 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  36.67 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  34.86 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  34.31 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  33.98 
 
 		 500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  35.13 
 
 		 505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  34.86 
 
 		 506 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  32.8 
 
 		 505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  31.71 
 
 		 552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  35.91 
 
 		 493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  33.78 
 
 		 535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  32.95 
 
 		 549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  34.34 
 
 		 486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  29.44 
 
 		 544 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  31.91 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  32.81 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  33.43 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  31.13 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  30.09 
 
 		 553 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  34.69 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  33.09 
 
 		 550 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  36.39 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  33.43 
 
 		 506 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  31.65 
 
 		 548 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  30.42 
 
 		 502 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  31.13 
 
 		 511 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  34.38 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  31.65 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  31.65 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  29.8 
 
 		 502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  30 
 
 		 502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  30 
 
 		 502 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  31.84 
 
 		 498 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  31.52 
 
 		 566 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 		 547 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  32.21 
 
 		 574 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  31.03 
 
 		 515 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  31.03 
 
 		 515 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  31.03 
 
 		 515 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  31.82 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  36.54 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 		 571 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  30.31 
 
 		 546 aa  150  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  30.5 
 
 		 574 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.77 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  35.2 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  33.9 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>