More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1975 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1975  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 295 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3479  transcriptional regulator, LysR family  53.29 
 
 		 297 aa  342  5.999999999999999e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1358  transcriptional regulator, LysR family  51.35 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0449  transcriptional regulator, LysR family  51.53 
 
 		 297 aa  314  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18090  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1907  transcriptional regulator  42.01 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1007  fhu operon transcription regulator  38.31 
 
 		 296 aa  215  9e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000456933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1189  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.544335 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0943  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27230  transcriptional regulator  37.46 
 
 		 294 aa  205  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07300  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  26.1 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2431  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  32.12 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3760  transcriptional regulator, LysR family  25.94 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.87 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  26.85 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  28.87 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  24.48 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  24.48 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  25.85 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0176  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  26.71 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.52 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  24.58 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2922  LysR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3228  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  32.49 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0063  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.52 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0026  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.52 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1823  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.52 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0044  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  26.21 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  26.21 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  26.21 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  28.14 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  26.21 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  26.21 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0047  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2959  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.17 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0036  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3264  transcriptional regulator, LysR family  27.63 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3038  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000600808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3271  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.87 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0045  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  25.58 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2833  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1543  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2815  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  26.9 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0835  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2958  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1730  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  26.03 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 295 aa  95.9  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1691  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1045  transcriptional regulator, LysR family  25.34 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1621  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.358841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2400  LysR substrate-binding  26.87 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2357  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>