37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1910 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  246  7e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1717  hypothetical protein  48.04 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  36.52 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  43.42 
 
 		 237 aa  60.5  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  42.25 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  28.72 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  42.25 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  29.9 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1398  hypothetical protein  28.07 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000179385 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  32.26 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  30.85 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  25.77 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  28.16 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  38.18 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  43.4 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  46.3 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  41.07 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  40 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  31.03 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  31.33 
 
 		 299 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  37.74 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0791  hypothetical protein  24.47 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  34.72 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  35.29 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 298 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>