More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1774 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  100 
 
 		 140 aa  286  7e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  75.71 
 
 		 140 aa  229  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  61.59 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  61.87 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  61.59 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  61.87 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  58.21 
 
 		 187 aa  163  9e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  55.15 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  51.94 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  51.52 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  48.85 
 
 		 162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  50.77 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  50.77 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  48.44 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  45.19 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  47.33 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  46.38 
 
 		 136 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  47.33 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  46.56 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  45.8 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  43.38 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  48.06 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  46.97 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  41.48 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  40.74 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  41.48 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  40.44 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  37.04 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  38.81 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  41.27 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  39.26 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  44.44 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  40.74 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 91 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  51.28 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  44.68 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  51.28 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  52.56 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  48.05 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  51.28 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  46.15 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2170  30S ribosomal protein S19  51.28 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000043951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  47.44 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  51.28 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  50 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  46.15 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  41.3 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  48.72 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  48.72 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  46.15 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  42.55 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  42.31 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  44.87 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  47.44 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>