98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2095 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2095  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  100 
 
 
255 aa  517  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0329891  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1961  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  42.16 
 
 
261 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  42.57 
 
 
255 aa  152  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1323  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  34.73 
 
 
254 aa  148  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1367  cobalt ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1949  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  40 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3434  hypothetical protein  40.93 
 
 
258 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.971737  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2634  cobalt transport protein  42.94 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.44 
 
 
252 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  38.55 
 
 
255 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1348  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  36.88 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.094753  hitchhiker  0.0000174719 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3138  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  40.51 
 
 
265 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1937  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  39.26 
 
 
256 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.118401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1192  cobalt ABC transporter, permease protein, putative  32.54 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00889776  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3949  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.13 
 
 
236 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3209  ABC cobalt transporter, inner membrane subunit, CbiQ  34.13 
 
 
236 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918003  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1131  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.9 
 
 
246 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1473  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.33 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.06 
 
 
252 aa  88.6  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.86 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0173  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit, putative  27.05 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.43 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1329  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.37 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1058  cobalt transport protein  24.71 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0541  putative cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  25.44 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2440  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  33.33 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1802  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.78 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.45 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.07 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0555  hypothetical protein  23.44 
 
 
215 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.257159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2781  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.47 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115944  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.58 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.87 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4056  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.98 
 
 
259 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2006  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.79 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0118677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2761  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  36.73 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1405  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.06 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.946346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2003  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  35.54 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.1214e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.55 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000240215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1280  cobalt ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2293  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.62 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1353  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0994  cobalt ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1199  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.48 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00978481  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  35.71 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  38.55 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4017  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.45 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0514  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  26.01 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.150411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  24.04 
 
 
269 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1571  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  30.71 
 
 
252 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1368  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.47 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.744959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2186  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.07 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00517893 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.16 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0091  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.35 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  22.41 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.51 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0485  cobalt transport protein  27.59 
 
 
256 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  21.81 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0774  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.64 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2133  cobalt transport protein, putative  20.45 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1046  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.73 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  24.08 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  24.43 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.58 
 
 
259 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.24 
 
 
279 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0034  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.74 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0846524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1754  cobalt transport protein  26.38 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0819489  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0745  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.08 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.19 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.890786  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  23.95 
 
 
293 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 
268 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1640  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.67 
 
 
313 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000368028 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  30.23 
 
 
279 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  25.83 
 
 
268 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  30.49 
 
 
233 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  26.26 
 
 
262 aa  45.4  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2048  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.61 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.14 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1795  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  24.14 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2065  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  25.61 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0206381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0491  cobalt transport protein  22.4 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.641356  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  20.75 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0691  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.71 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  29.07 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2111  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.61 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  0.0223039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1779  cobalt transport protein  23.67 
 
 
216 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.719291  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.18 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1637  cobalt transport protein  30.14 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.125207  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0144  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.48 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3002  cobalt ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0190  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.61 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000816865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  29.63 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0296  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.33 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.149424  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1042  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  39.53 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  24.81 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1118  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.24 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933016 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1390  excinuclease ABC subunit C  23.79 
 
 
281 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  24.64 
 
 
243 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>