More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8814 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  100 
 
 
436 aa  897    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  63.84 
 
 
436 aa  585  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  59.37 
 
 
464 aa  535  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  59.46 
 
 
460 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  56.68 
 
 
449 aa  488  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  58 
 
 
449 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  57.91 
 
 
449 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  56.74 
 
 
443 aa  478  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  55.4 
 
 
445 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  55.87 
 
 
443 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  55.53 
 
 
451 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  61.68 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  55.58 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  54.94 
 
 
451 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  53.76 
 
 
455 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  53.7 
 
 
450 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  53.94 
 
 
441 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  44.94 
 
 
441 aa  348  9e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  40.97 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  38.67 
 
 
418 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  38.57 
 
 
424 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  38.38 
 
 
421 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  38.42 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  37.14 
 
 
427 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  36.73 
 
 
435 aa  250  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  37.2 
 
 
426 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  37.67 
 
 
428 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  37.82 
 
 
414 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  35.71 
 
 
430 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
430 aa  246  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  35.34 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  36.46 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  36.46 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  35.71 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  36.1 
 
 
431 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  36.2 
 
 
432 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 
430 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  36.86 
 
 
431 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  36.49 
 
 
427 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 
338 aa  163  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  43.16 
 
 
392 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.19 
 
 
337 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
339 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 
337 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 
339 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.17 
 
 
342 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
342 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.69 
 
 
342 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.83 
 
 
341 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.01 
 
 
350 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
342 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  26.86 
 
 
361 aa  123  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.8 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.93 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.82 
 
 
342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.38 
 
 
342 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.12 
 
 
340 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.67 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
327 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
322 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.19 
 
 
333 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 
333 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.11 
 
 
333 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
322 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  29.26 
 
 
344 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
333 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.47 
 
 
333 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  27.47 
 
 
364 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.67 
 
 
338 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
346 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
333 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 
340 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.3 
 
 
329 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  24.93 
 
 
325 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.46 
 
 
325 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  26.59 
 
 
329 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.65 
 
 
334 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.93 
 
 
328 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.39 
 
 
334 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.84 
 
 
323 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 
336 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.66 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  24.46 
 
 
333 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5498  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.7 
 
 
355 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
335 aa  96.3  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  24.93 
 
 
342 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.9 
 
 
335 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  26.17 
 
 
331 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  25.9 
 
 
335 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.42 
 
 
341 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.97 
 
 
359 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.51 
 
 
342 aa  95.1  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  26.69 
 
 
329 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>