More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6221 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  100 
 
 		 425 aa  883    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  65.44 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  67.09 
 
 		 426 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  65.76 
 
 		 421 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  64.95 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  65.32 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  64.32 
 
 		 431 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  66.16 
 
 		 435 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  64.65 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  62.89 
 
 		 430 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  62.89 
 
 		 430 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  63.73 
 
 		 432 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  63.37 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  63.22 
 
 		 432 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  62.65 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  63.22 
 
 		 432 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  62.38 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  63.64 
 
 		 428 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  46.78 
 
 		 414 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  49.75 
 
 		 418 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  67.58 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  42.64 
 
 		 401 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  42.97 
 
 		 464 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  40.52 
 
 		 468 aa  302  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  40.42 
 
 		 451 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  41.91 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  43.27 
 
 		 443 aa  298  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  40.2 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  40.44 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  40.66 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  41.36 
 
 		 450 aa  288  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  41.88 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  41.81 
 
 		 449 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  41.56 
 
 		 449 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  44.2 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  40.97 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  38.98 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  41.03 
 
 		 460 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  39.47 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  41.98 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.8 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.61 
 
 		 342 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 342 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.81 
 
 		 346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.82 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.66 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.26 
 
 		 337 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3394  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 1823 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.45 
 
 		 341 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 		 340 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 1912 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2930  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 1912 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0842557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.25 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.82 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 		 340 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.15 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.36 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  28.12 
 
 		 342 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 		 342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.12 
 
 		 342 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 342 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.84 
 
 		 342 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.12 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.29 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28 
 
 		 342 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.85 
 
 		 331 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  27.09 
 
 		 347 aa  99.8  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  27.91 
 
 		 340 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.66 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.85 
 
 		 335 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.57 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 		 335 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.85 
 
 		 331 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.57 
 
 		 331 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27 
 
 		 340 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.3 
 
 		 338 aa  96.3  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.3 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>