More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0960 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  80.24 
 
 		 421 aa  715    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  96.74 
 
 		 430 aa  877    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  81.17 
 
 		 431 aa  722    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  77.75 
 
 		 424 aa  684    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 430 aa  899    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  78.74 
 
 		 432 aa  703    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  80.93 
 
 		 430 aa  749    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  78.88 
 
 		 427 aa  701    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  79.71 
 
 		 432 aa  709    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  85.12 
 
 		 435 aa  786    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  78.99 
 
 		 432 aa  706    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  78.1 
 
 		 428 aa  690    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  78.76 
 
 		 427 aa  708    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  99.77 
 
 		 430 aa  897    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  85.45 
 
 		 426 aa  789    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  87.88 
 
 		 429 aa  809    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  80.68 
 
 		 431 aa  716    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  62.89 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  74.58 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  49.62 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  44.15 
 
 		 414 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  44.39 
 
 		 401 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  41.45 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  38.46 
 
 		 468 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  40.53 
 
 		 443 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  38.5 
 
 		 445 aa  293  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  39.02 
 
 		 451 aa  293  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  40.05 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  38.18 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  40.6 
 
 		 451 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  41.07 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  40.56 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  39.9 
 
 		 455 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  39.12 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  38.11 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  35.71 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  38.93 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  36.27 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  35.26 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  38.58 
 
 		 451 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.35 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3394  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 1823 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.81 
 
 		 341 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.86 
 
 		 346 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 1912 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2930  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 1912 aa  136  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0842557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.03 
 
 		 337 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.18 
 
 		 342 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.18 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 		 342 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.98 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.95 
 
 		 340 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 		 337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.47 
 
 		 342 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  26.76 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.12 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  26.42 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 		 331 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  27.14 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.62 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.7 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.7 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.75 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.86 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.88 
 
 		 338 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4029  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.84 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.97 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.57 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.2 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.63 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  26.69 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.58 
 
 		 323 aa  103  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.22 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  26.14 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.4 
 
 		 332 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.97 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.97 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.07 
 
 		 321 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  27.91 
 
 		 320 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.93 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  26.63 
 
 		 336 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.4 
 
 		 332 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.98 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.4 
 
 		 332 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  26.4 
 
 		 332 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.29 
 
 		 342 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 		 337 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>