More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4689 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  100 
 
 		 401 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  45.85 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  44.39 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  44.39 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  44.39 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  43.85 
 
 		 430 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  44.36 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  43.15 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  43.15 
 
 		 429 aa  329  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  42.46 
 
 		 427 aa  325  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  43.33 
 
 		 427 aa  318  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  43.08 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  42.35 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  42.31 
 
 		 431 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  41.84 
 
 		 421 aa  312  7.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  42.31 
 
 		 432 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  42.31 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  42.31 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  42.05 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  42.64 
 
 		 425 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  43.94 
 
 		 418 aa  299  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  38.42 
 
 		 436 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  36.57 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  35.47 
 
 		 451 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  35.47 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  37.05 
 
 		 441 aa  229  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  35.88 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  35.75 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  35.27 
 
 		 445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  35.19 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  35.29 
 
 		 436 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  35.32 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  36.2 
 
 		 449 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  34.83 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  33.73 
 
 		 443 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  34.81 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  35.94 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  33.85 
 
 		 450 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  46.08 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  35.68 
 
 		 451 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.14 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.98 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.88 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.49 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.81 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  25.92 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 		 344 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.85 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.69 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  25.84 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.92 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.93 
 
 		 341 aa  110  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.93 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.93 
 
 		 329 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.93 
 
 		 329 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.93 
 
 		 329 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  24.93 
 
 		 329 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  25.32 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.36 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  27.62 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.22 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  25.14 
 
 		 329 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.35 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.51 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  26.12 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5498  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.06 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  25 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3394  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 1823 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0227  alcohol dehydrogenase  24.74 
 
 		 349 aa  99.8  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.56 
 
 		 337 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.01 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0617  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.63 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  24.3 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  28.83 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  25.42 
 
 		 339 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5230  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.57 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  0.793838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.53 
 
 		 338 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25 
 
 		 339 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2578  alcohol dehydrogenase  25.92 
 
 		 352 aa  96.3  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 321 aa  96.3  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  25.19 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.32 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.68 
 
 		 323 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.97 
 
 		 341 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 		 344 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.58 
 
 		 341 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 1912 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2930  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 1912 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0842557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>