104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8574 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  100 
 
 		 165 aa  316  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.83 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.56 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  31.79 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  35.26 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  28.4 
 
 		 173 aa  87.4  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  26.99 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  30.64 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  30.06 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.64 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  30.11 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  28.32 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.36 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.06 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  28.74 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.2 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  29.17 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.89 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.51 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  27.73 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  30.99 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  25.71 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.69 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.33 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.57 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.64 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  22.81 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.49 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  27.53 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  27.53 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.15 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.54 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  26.55 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3510  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.57 
 
 		 228 aa  51.2  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.261645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1136  glycine cleavage system transcriptional repressor  45.65 
 
 		 183 aa  50.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  45.65 
 
 		 183 aa  50.8  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02371  DNA-binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA  25.77 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1190  amino acid-binding ACT domain protein  25.77 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.84 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2611  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.77 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2761  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.77 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1197  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.77 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2626  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.77 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2851  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.77 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3701  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.77 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02333  hypothetical protein  25.77 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.43 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2553  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.43 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000108497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2668  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.43 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000549184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.62 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  43.48 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  43.48 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  43.48 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  43.48 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  43.48 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1791  amino acid-binding ACT domain protein  21.43 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000108735  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2985  amino acid-binding ACT domain protein  43.48 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2413  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.3 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204037  hitchhiker  0.00509125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2341  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  21.3 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1655  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  21.3 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1246  glycine cleavage system transcriptional repressor  41.3 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3131  glycine cleavage system transcriptional repressor  41.3 
 
 		 204 aa  47.8  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.590147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1361  glycine cleavage system transcriptional repressor  41.3 
 
 		 204 aa  47.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.243595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1878  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.24 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1701  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.24 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0560544  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  31.17 
 
 		 88 aa  47.4  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.69 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  32.61 
 
 		 309 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2975  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.76 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  46.15 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1071  amino acid-binding ACT domain protein  41.3 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  40.35 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  72.41 
 
 		 280 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  26.19 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  25.34 
 
 		 1319 aa  44.3  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  34.67 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  28.57 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  44.9 
 
 		 90 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.27 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  30.77 
 
 		 93 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  39.29 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  40.79 
 
 		 282 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  28.83 
 
 		 420 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92178  predicted protein  24.84 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  23.6 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  22.44 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  38.33 
 
 		 90 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  44.9 
 
 		 90 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  48.28 
 
 		 285 aa  42  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  26.71 
 
 		 385 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  41.6  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  43.4 
 
 		 90 aa  41.6  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  25.4 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.5 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  40.74 
 
 		 95 aa  41.2  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  26.01 
 
 		 196 aa  40.8  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  21.88 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  37.68 
 
 		 90 aa  40.8  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  40.82 
 
 		 90 aa  40.8  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>