More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4670 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  66.91 
 
 
138 aa  194  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  65.44 
 
 
138 aa  187  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  65.44 
 
 
138 aa  187  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  58.46 
 
 
181 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  58.46 
 
 
181 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  58.46 
 
 
181 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  58.46 
 
 
181 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  58.46 
 
 
181 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3439  IS1647-like transposase  54.81 
 
 
162 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4462  IS1647-like transposase  55.88 
 
 
128 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  44.44 
 
 
139 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  47.66 
 
 
254 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  47.66 
 
 
254 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  47.66 
 
 
254 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  47.66 
 
 
254 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  47.66 
 
 
254 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  45.95 
 
 
125 aa  97.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  45.38 
 
 
121 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  45.38 
 
 
121 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  45.38 
 
 
121 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  42.48 
 
 
123 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  42.48 
 
 
123 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  42.48 
 
 
123 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  42.48 
 
 
123 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  42.48 
 
 
123 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  45.79 
 
 
123 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  45.79 
 
 
123 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  45.79 
 
 
123 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  45.38 
 
 
126 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  45.79 
 
 
142 aa  94.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  42.86 
 
 
135 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  45.05 
 
 
125 aa  94.4  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  46.73 
 
 
142 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  46.73 
 
 
142 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
304 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  43.7 
 
 
121 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  45.79 
 
 
254 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  43.7 
 
 
121 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  43.7 
 
 
121 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  45.79 
 
 
254 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.14 
 
 
158 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  45.79 
 
 
254 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  45.79 
 
 
254 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  45.79 
 
 
254 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  45.79 
 
 
254 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.64 
 
 
252 aa  92  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  42.86 
 
 
121 aa  91.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  42.86 
 
 
121 aa  91.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  42.86 
 
 
121 aa  91.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  42.86 
 
 
121 aa  91.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  42.86 
 
 
121 aa  91.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  42.86 
 
 
121 aa  91.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  42.86 
 
 
121 aa  91.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  42.98 
 
 
260 aa  91.3  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 
117 aa  90.9  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 
117 aa  90.9  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 
117 aa  90.9  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  42.98 
 
 
260 aa  90.9  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 
117 aa  90.9  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 
117 aa  90.9  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  42.98 
 
 
260 aa  90.9  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  42.98 
 
 
260 aa  90.9  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  42.34 
 
 
117 aa  90.9  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  45.87 
 
 
132 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  45.87 
 
 
132 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  42.02 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  42.02 
 
 
121 aa  89  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  42.02 
 
 
121 aa  89  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  43.93 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  38.94 
 
 
129 aa  88.2  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  38.94 
 
 
129 aa  88.2  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  38.94 
 
 
129 aa  88.2  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  38.94 
 
 
129 aa  88.2  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  38.94 
 
 
135 aa  88.2  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  38.94 
 
 
129 aa  88.2  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  38.94 
 
 
129 aa  88.2  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  41.96 
 
 
122 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  40.71 
 
 
139 aa  88.2  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  45.71 
 
 
142 aa  87.8  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  45.71 
 
 
142 aa  87.8  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  43.75 
 
 
255 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  38.94 
 
 
135 aa  87.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  38.94 
 
 
135 aa  87.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  37.84 
 
 
143 aa  87  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  46.43 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  44.14 
 
 
129 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.52 
 
 
281 aa  85.5  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  41.96 
 
 
122 aa  84.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  41.96 
 
 
122 aa  84.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  38.84 
 
 
157 aa  84.7  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  34.81 
 
 
260 aa  84.3  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.04 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  38.14 
 
 
122 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  38.14 
 
 
122 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  40.38 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.11 
 
 
281 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  41.07 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  42.99 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00502  transposase  36.44 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>