More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2528 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2528  sugar transferase  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3172  galactosyl transferase  94.02 
 
 
185 aa  316  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3032  galactosyl transferase, capsular polysaccharide synthesis enzyme  84.07 
 
 
182 aa  300  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1485  sugar transferase  89.01 
 
 
182 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00302801  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2877  sugar transferase  91.3 
 
 
184 aa  297  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  72.38 
 
 
508 aa  273  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0590  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  71.82 
 
 
188 aa  268  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.67 
 
 
506 aa  265  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  64.84 
 
 
182 aa  263  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  64.84 
 
 
182 aa  262  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  66.48 
 
 
185 aa  252  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1277  sugar transferase  61.88 
 
 
183 aa  238  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470933 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2640  putative capsule biosynthesis protein  66.12 
 
 
184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2612  sugar transferase  72.19 
 
 
186 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00297652  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1843  galactosyl-transferase, putative  60.87 
 
 
191 aa  224  6e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1539  sugar transferase  56.59 
 
 
183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0350538  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0745  sugar transferase  48.89 
 
 
451 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  53.55 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  39.34 
 
 
211 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  43.29 
 
 
210 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  51.05 
 
 
185 aa  134  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  51.05 
 
 
185 aa  134  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  42.24 
 
 
211 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  39.43 
 
 
186 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3985  sugar transferase  46.53 
 
 
186 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1493  sugar transferase  44.74 
 
 
200 aa  121  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.14 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2247  capsular polysaccharide synthesis protein  40.12 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.436876  hitchhiker  0.00758225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  39.67 
 
 
186 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1277  sugar transferase  41.67 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0679585  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3481  sugar transferase  46.72 
 
 
186 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0937708  normal  0.263675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  37.79 
 
 
187 aa  117  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1263  sugar transferase  49.31 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  43.06 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  38.59 
 
 
188 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  38.29 
 
 
188 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  40.96 
 
 
230 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  44.44 
 
 
186 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  40.96 
 
 
194 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6006  sugar transferase  40.38 
 
 
219 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.53 
 
 
207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  35.87 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3821  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.38 
 
 
206 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10743  putative undecaprenyl-phosphate glycosyl-1-phosphate transferase  38.69 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5883  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.72 
 
 
482 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1752  sugar transferase  43.33 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  36.32 
 
 
466 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  44.06 
 
 
358 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0631  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.48 
 
 
234 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  43.36 
 
 
329 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  45.52 
 
 
458 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.41 
 
 
501 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.41 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0466  capsular polysaccharide biosynthesis protein  46 
 
 
222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000106234  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  38.01 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.06 
 
 
346 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.24 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.46 
 
 
231 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3064  sugar transferase  39.11 
 
 
490 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  37.76 
 
 
461 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.59 
 
 
207 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2744  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.91 
 
 
480 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000314973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3367  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.91 
 
 
480 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3218  sugar transferase  39.67 
 
 
467 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4820  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.45 
 
 
242 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.86 
 
 
219 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  35.47 
 
 
230 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1034  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.46 
 
 
490 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0716  sugar transferase  42.65 
 
 
207 aa  104  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2000  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.26 
 
 
215 aa  104  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0584  glycosyltransferase  43.62 
 
 
209 aa  104  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000164965  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1573  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  37.24 
 
 
470 aa  104  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3299  sugar transferase  43.97 
 
 
215 aa  104  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4955  sugar transferase; phospho-glucosyltransferase  42.76 
 
 
228 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228905  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5365  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  52.83 
 
 
205 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4237  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.52 
 
 
246 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.952439  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3055  sugar transferase  43.97 
 
 
185 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0289744 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0595  sugar transferase family protein  36.22 
 
 
220 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.750917  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0454  glycosyltransferase, putative  43.33 
 
 
222 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000102874  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.74 
 
 
491 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1879  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.61 
 
 
314 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.439269  hitchhiker  0.0000110821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.98 
 
 
473 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4061  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.63 
 
 
522 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0793  sugar transferase  39.62 
 
 
216 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.75 
 
 
217 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1487  sugar transferase  39.58 
 
 
202 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  35.09 
 
 
243 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1192  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.56 
 
 
237 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2523  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.53 
 
 
226 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0494  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.12 
 
 
219 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  43.92 
 
 
402 aa  101  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2589  sugar transferase  33.51 
 
 
225 aa  101  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1211  putative sugar transferase  35.88 
 
 
201 aa  101  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.24 
 
 
454 aa  101  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003543  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  38.04 
 
 
212 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  43.48 
 
 
365 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3537  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.32 
 
 
488 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569176 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0450  Cpp29  42.45 
 
 
201 aa  100  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3920  sugar transferase  41.73 
 
 
199 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00326653 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1153  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  36.96 
 
 
219 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000801839  hitchhiker  0.000000000000434208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>