34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1664 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  594  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  86.55 
 
 		 290 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  86.55 
 
 		 290 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  86.55 
 
 		 290 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  86.32 
 
 		 285 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  76.82 
 
 		 290 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  74.74 
 
 		 290 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  75.78 
 
 		 290 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  75.09 
 
 		 290 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  53.79 
 
 		 283 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  50.36 
 
 		 281 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  49.64 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  29.02 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  28.35 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  29.04 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  27.21 
 
 		 289 aa  99.8  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  24.72 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  28.24 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  26.14 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  26.58 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  23.3 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  23.97 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  22.94 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  25.45 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  24.05 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  21.94 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  21.15 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  22.9 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  22.9 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  24.54 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  22.3 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  21.68 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  23.13 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>