22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4715 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4715  O-antigen polymerase  100 
 
 		 545 aa  1083    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  31.96 
 
 		 561 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  32.19 
 
 		 594 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  30.52 
 
 		 597 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  29.31 
 
 		 585 aa  187  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  32.51 
 
 		 552 aa  176  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  29.48 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0423  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 557 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  33.93 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  27.38 
 
 		 595 aa  50.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  27.74 
 
 		 438 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  25.44 
 
 		 737 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  25.11 
 
 		 580 aa  47  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  28.18 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  28.18 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  26.28 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  28.18 
 
 		 426 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1394  O-antigen polymerase  27.82 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0739482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  32.56 
 
 		 443 aa  44.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  27.94 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  39.66 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  34.21 
 
 		 431 aa  43.5  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>