More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0732 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
256 aa  513  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  73.73 
 
 
255 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  73.73 
 
 
255 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  73.73 
 
 
255 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  68.75 
 
 
256 aa  352  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  68.75 
 
 
256 aa  345  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  66.27 
 
 
255 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  63.36 
 
 
255 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  65.1 
 
 
255 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  66.41 
 
 
254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  66.15 
 
 
254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  66.02 
 
 
254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  66.02 
 
 
254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  65.35 
 
 
254 aa  325  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  66.02 
 
 
254 aa  325  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  66.02 
 
 
254 aa  325  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  66.02 
 
 
254 aa  325  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  65.23 
 
 
254 aa  323  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  61.81 
 
 
255 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  61.42 
 
 
255 aa  307  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  61.42 
 
 
255 aa  307  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  61.42 
 
 
255 aa  307  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  61.81 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.58 
 
 
671 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.5 
 
 
668 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.84 
 
 
438 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.27 
 
 
438 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  32.66 
 
 
678 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  33.33 
 
 
681 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  33.02 
 
 
678 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  37.89 
 
 
438 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35 
 
 
664 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.69 
 
 
664 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  35.53 
 
 
437 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  36.94 
 
 
176 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  35.53 
 
 
437 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  35.36 
 
 
641 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  30.19 
 
 
220 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  30.23 
 
 
220 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  37.06 
 
 
176 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  38.24 
 
 
176 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  32.49 
 
 
682 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  30.6 
 
 
695 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  32.49 
 
 
682 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  31.71 
 
 
677 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  38.46 
 
 
438 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  37.5 
 
 
439 aa  99.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  32.98 
 
 
438 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  32.48 
 
 
232 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  32.7 
 
 
176 aa  95.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.51 
 
 
438 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  32.18 
 
 
176 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.51 
 
 
438 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  32.77 
 
 
220 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.47 
 
 
438 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  32.35 
 
 
176 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.34 
 
 
662 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  35.03 
 
 
176 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.89 
 
 
469 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  30.43 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  30.41 
 
 
218 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  29.05 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.32 
 
 
676 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  30.15 
 
 
205 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 
173 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 
241 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  34.46 
 
 
176 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  36.18 
 
 
173 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  36.18 
 
 
173 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.38 
 
 
684 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  36.84 
 
 
173 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  29.88 
 
 
684 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  30.52 
 
 
179 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  30.26 
 
 
173 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.48 
 
 
483 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  30.52 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  31.25 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.85 
 
 
664 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  35.33 
 
 
672 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  28.95 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  33.33 
 
 
672 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  28.7 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  34.84 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  35.29 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  34.51 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  33.33 
 
 
672 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  36.96 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  36.96 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  36.96 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.36 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  26.95 
 
 
211 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  28.29 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  28.48 
 
 
686 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  26.67 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  26.97 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  34.06 
 
 
502 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  32.16 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.11 
 
 
702 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  28.26 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>