51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0257 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  100 
 
 		 241 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  44.49 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  46.08 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  46.08 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  45.59 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  46.08 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  45.1 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  45.1 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  45.1 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  45.1 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  45.1 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  45.1 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  45.1 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  45.1 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  45.1 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  41.67 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  40.58 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  43.68 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  42.35 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  45.2 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  41.71 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  43.37 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  41.29 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  44.44 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  42.37 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  39.49 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  47.49 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  37.44 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  43.53 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  42.78 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  42.35 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  42.35 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  39.81 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  38.24 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  42.35 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  42.35 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  40.12 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  37.25 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  35.89 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  38.73 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  41.76 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  41.76 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  41.35 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  34.45 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  38.12 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  31.88 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  33.33 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  26.81 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  32 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  35.63 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  26.58 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>