34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2602 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  344  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  43.86 
 
 
171 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  47.02 
 
 
175 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  44.3 
 
 
212 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  43.62 
 
 
218 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  42.95 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  42.28 
 
 
218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  46.67 
 
 
164 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  39.39 
 
 
187 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  45.83 
 
 
197 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  35.98 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  41.67 
 
 
197 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  41.67 
 
 
197 aa  91.7  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  34.36 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  40.97 
 
 
197 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  32.93 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  37.43 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  37.17 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  37.17 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  31.33 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  32.96 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  32.47 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  34.45 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  31.3 
 
 
168 aa  61.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  31.11 
 
 
158 aa  60.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  30.61 
 
 
158 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  28.75 
 
 
170 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  28.21 
 
 
173 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  35.71 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  29.2 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  34.29 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  30.83 
 
 
238 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  26.32 
 
 
159 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>