30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1500 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1500  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2860  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.78 
 
 		 118 aa  144  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689813  hitchhiker  0.0000000253321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2334  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 119 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00585088  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2262  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 119 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40465  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1785  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000697437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2453  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2005  dksA-type zinc finger protein  56.3 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1761  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.62 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.002786  hitchhiker  0.0085611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2582  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2310  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2623  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.78 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0172808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0227937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2243  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176071  hitchhiker  0.000769405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1302  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.893373  normal  0.0630763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2389  hypothetical protein  61.73 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000590846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2415  transcriptional regulators, TraR/DksA family protein  44.63 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1980  dnaK suppressor  39.66 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1557  hypothetical protein  25.22 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  34.69 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4453  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.142377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  39.13 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4875  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.42 
 
 		 130 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  41.86 
 
 		 341 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.38 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>