More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1411 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1411  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
316 aa  633  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3023  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
325 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  0.087173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
327 aa  109  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01361  hypothetical protein  28.63 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.34 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
280 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
1007 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  27.57 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
581 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  22.88 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  31.65 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  27.6 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.85 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  22.55 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
398 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
274 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
324 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.21 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
313 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  27.07 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.41 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
358 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 
257 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  21.07 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
289 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.56 
 
 
341 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  22.73 
 
 
727 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  23.35 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
853 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
276 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.2 
 
 
266 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.65 
 
 
266 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
350 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
256 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
280 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0042  glycosyl transferase family 2  21.78 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.74 
 
 
274 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
663 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
349 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0044  glycosyl transferase family 2  21.78 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.09 
 
 
266 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
330 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  27.12 
 
 
355 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
363 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.2 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  29.2 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>